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          2. 再創佳績,義翹神州再次高效率成功表達N501Y突變體重組蛋白

            來源: 北京義翹神州科技有限公司   2020-12-28   訪問量:960評論(0)

            近期,英國出現的新冠病毒突變體引起全世界的關注,“傳染性高出70%”、“倫敦緊急封城”、“大量民眾逃離”等等。為應對新冠病毒新變種,目前已有超過40個國家對英國實施入境禁令,我國在24日暫停中英間的往返航班。據世衛組織表示已有5國出現類似病例,在23日,以色列、新加坡和香港特區也有新毒株病例出現。

            那么新毒株到底有多危險呢?目前科學界對它的了解又有多少?

            英國突變位點之多創歷史

            我們結合英國科學家在virological.org上傳的新突變株序列,以及《science》雜志發表的一篇報道,對暫時命名為B.1.1.7亞型的新毒株(英國將病毒命名為“VUI-202012/01”,即“2020121日出現的待調查毒株”)已知情況進行了梳理。


            (源自GISAID,新冠病毒Spike突變體的3D結構,其中青藍為69-70del、145del突變,寶藍為D614G、A570D、P681H、T716I、S982A、D1118H突變,黃色為N501Y突變)

            愛丁堡大學的Andrew Rambaut上傳的序列中,指出這個新毒株有23個特殊的突變,這是首次發現在一個毒株上出現如此多的變異。序列顯示B.1.1.7亞型是在廣泛流行的D614G突變株基礎上發生突變。其中有8個突變發生在刺突蛋白Spike上,包含69-70缺失、145缺失及N501Y、A570D、D614G、P681H、T716I、S982A、D1118H突變;其次ORF8ORF1ab也有多個位點發生突變。


            (源自virological.org

            關于N501Y突變

            據《Cell》報道,刺突蛋白是新冠病毒表面與人體細胞ACE2受體結合的部位,而刺突蛋白Q493、Q498N501位點突變會提高病毒與人體細胞表面ACE2受體的親和力,增強新冠病毒的傳染力。因此科學家推測英國出現的突變株傳染性提高70%,極有可能與N501Y突變有關。

            在刺突蛋白的受體結合域RBD6個關鍵的受體接觸殘基,而N501正是其中之一。在小鼠模型中,通過實驗已經證實N501Y能夠增強病毒與人和小鼠ACE的結合親和力。

            近日也有報道南非出現新的病毒突變體,同樣發現存在N501Y突變。南非衛生部門發現,該突變體在刺突蛋白的受體結合域存在3個位點突變:K417N、E484KN501Y。其中E484KN501Y屬于受體結合基序,是與人ACE2受體形成結合的主要位點。


            (源自GISAID,新冠病毒Spike突變體的3D結構,左側為ON狀態,右側為OFF狀態,其中黑色為D80A、D215G突變,藍色為D614G、A701V突變,黃色為N501Y、E484K、K417N突變,綠色表示ACE2

            但是N501Y突變是否對變異病毒的傳染性及其對疾病嚴重性的影響意味著什么,還是未知數,需要更多的實驗進行驗證。

            關于69-70缺失

            69-70缺失,會導致刺突蛋白69-70位的兩個氨基酸缺失,已在多個RBD相關突變的譜系中發現,比如丹麥水貂突變體中,同樣存在69-70缺失。研究人員在一些免疫功能低下的患者中,發現這種突變可能有利于病毒逃逸宿主的免疫反應。也就是說69-70del可能會造成人體免疫系統無法識別新冠病毒。

            關于新冠病毒突變

            7月份,我國科學家在《Cell》發文,對新冠病毒變異進行系統性研究和介紹,從已知的刺突蛋白基因序列上鑒定出106個變異位點!Science》也有相關的報道,稱12月病毒毒株至少存在200個位點上的不同,與“初代”新冠病毒相比。

            3月,D614G突變株成為歐洲的主要流行株,使病毒的感染率提高2.4-7.7倍。此后,多數突變株是在此基礎上進行變異的,比如丹麥水貂突變Y453F,以及近期出現的英國突變N501Y和南非突變株。

            關于突變體,人們出了關心其傳染能力是否增強,更多的關注是疫苗是否還有用?王晨光教授曾在《新冠病毒變異可怕嗎?》中指出,英國新突變株雖然有8個突變在刺突蛋白上,但引起較大的蛋白質構象變化的可能性較小!Science》、美聯社等媒體也引用多名專家的分析,認為突變對疫苗的影響不大,但是還需要更多的實驗數據證實。

            義翹神州已經建立全球領先的新冠病毒突變株抗原庫,目前上線RBD突變株重組蛋白以及超過70種,支持科研人員進行突變株對新冠病毒傳播、臨床、診斷、疫苗及藥物開發影響的研究。

            1.https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563

            2.https://www.sciencemag.org/news/2020/12/mutant-coronavirus-united-kingdom-sets-alarms-its-importance-remains-unclear



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